Pendirian MIN 1 Pekanbaru diawali dengan nama SD Latihan PGA pada tahun 1960 yang beralamat di Jalan Diponegoro Pekanbaru. Pada tahun 1970 SD Latihan PGA berubah menjadi Madrasah Ibtidaiyah Latihan PGA ( MI Lat PGA ). Pada tahun 1987 MI Lat PGA berubah menjadi Madrasah Ibtidaiyah Negeri Filial MIN Berakit Tanjung Pinang, sebagai persiapan menjadi Madrasah Negeri. Pada tahun 1991 resmi menjadi Madrasah Ibtidaiyah Negeri ( MIN ) Pekanbaru,yang di SK kan oleh Menteri Agama Republik Indonesia dengan nomor SK 137 TAHUN 1991 tanggal 11 Juli 1991 yang kemudian berubah menjadi Madrasah Ibtidaiyah Negeri 1 Pekanbaru.
MIN 1 Pekanbaru beralamat di Jalan Sumatera No.19 a Pekanbaru, yang sangat strategis karena terletak di jantung kota Pekanbaru, mudah dijangkau dari manapun dan berdekatan dengan kantor-kantor pemerintahan.
Seiring berjalannya waktu MIN 1 Pekanbaru terus membenahi diri, peningkatan sarana dan prasarana terus dilakukan. Saat ini MIN 1 Pekanbaru sudah menjadi Madrasah Ibtidaiyah yang besar dengan jumlah siswa untuk tahun pembelajaran 2016/2017 ini berjumlah 906 orang yang tersebar kedalam 24 rombel. Dengan 48 orang tenaga pendidik dan kependidikan.